Ανάμεσα στη Χώρα και τα Αγγίδια, αριστερά του κεντρικού δρόμου και πάνω σε ένα λοφίσκο, βρίσκονται τα ερείπια μιας αρχαίας χριστιανικής εκκλησίας που κατά την παράδοση ήταν αφιερωμένη στον Πρωτομάρτυρα Στέφανο.
Την παλαιοχριστιανική περίοδο (6ος αιώνας) είχε μεγάλες διαστάσεις (13 𝔵 25 μέτρα περίπου).
Ήταν τρίκλιτη βασιλική και είχε πέντε κίονες σε κάθε κλίτος. Οι κίονες ήταν μέλη αρχαιότερων κτισμάτων σε δεύτερη χρήση εδώ. Στα ανατολικά είχε μια μεγάλη κεντρική αψίδα.
Κατά τους μεσοβυζαντινούς χρόνους ο ναός περιορίστηκε αρκετά σε διαστάσεις. Παρέμεινε τρίκλιτος, αλλά αντί για μία μεγάλη αψίδα τώρα απέκτησε τρεις μικρότερες.
Την περίοδο της Ενετοκρατίας σμικρύνθηκε ακόμη περισσότερο. Αυτή ήταν και η τελευταία περίοδος μεταβολών της εκκλησίας.
Ο χώρος δυτικά του ναού χρησιμοποιήθηκε για ταφές. Οι τάφοι λαξεύονταν στο μαλακό βράχο και καλύπτονταν με πλάκες.
Στο χώρο αυτό ετάφη και ο δούκας της Νάξου Νικόλαος Καρτσέρι, που δολοφονήθηκε το 14ο μ.Χ. αιώνα από τον άρχοντα της Μήλου Φραγκίσκο Κρίσπο κατά τη διάρκεια κυνηγιού στην κοιλάδα των Μελάνων.
Ο δολοφόνος σφετερίστηκε την εξουσία του Καρτσέρι και το Δουκάτο πέρασε στα χέρια των Κρίσπων. Την περίοδο αυτή κτίστηκε και η καθολικού δόγματος εκκλησία του Ευαγγελισμού που βρίσκεται σε κοντινή θέση («Φραρώ»)
Πηγή : Η ερειπιώδης βασιλική του Αγίου Στεφάνου στα Αγγίδια! Της Αρχαιολόγου Ειρήνης Βασιλάκη
Φωτογραφία: Μαρία Διαμαντάρα
